Majalah Ribon edisi September telah mengumumkan bahwa Little Witch Academia akan diangkat menjadi manga yang akan terbit pertama kali pada tanggal 3 September mendatang. Yuka Fujiwara (Crash!, RaRaRa Hallelujah!) berkesempatan menangani manga yang berjudul Little Witch Academia: Tsukiyo no Oukan (Crown of Midnight) ini dan Yoh Yoshinari sebagai studara anime-nya akan tertulis sebagai original creator-nya.

"Karakter utamanya yang telah lama menantikan ingin menjadi penyihir bertemu dengan seorang pria!?" menjadi tagline-nya.

Selain itu, pada tanggal 18 Juli edisi Agustus majalah Ultra Jump juga mengumumkan akan mengangkat manga lain dari Little Witch Academia yang akan terbit 19 Agustus. Terio Teri akan menggambar manga Little Witch Academia tersebut yang akan memiliki cerita original dan Studio Trigger tertulis sebagai original creator-nya.