Dalam volume ke-7 dari manga The Disappearance of Nagato Yuki-chan, sebuah pengumuman mengungkapkan bahwa adaptasi serial anime-nya dijadwalkan untuk tayang perdana tahun 2015. Rincian lebih lanjutnya tidak disertakan.
Ceritanya mengungkap dalam dunia The Disappearance of Haruhi Suzumiya, di mana Yuki Nagato bukan alien. Sebaliknya, ia adalah ketua yang pemalu dari klub sastra di sekolahnya. Manga-nya memungkinkan para pembaca melihat karakter Haruhi Suzumiya yang asli, Yuki dan Kyon, dalam suatu cahaya baru. The Disappearance of Nagato Yuki-chan adalah manga spin-off yang ditulis dan diilustrasikan oleh Puyo. Produksi untuk anime yang akan datang ini awalnya terungkap pada haruhi.tv Desember yang lalu.